A principios del año 2000, CAMPO, inició un importante proceso de refundación institucional, al seguir una estrategia más integral, para el impulso al desarrollo rural sustentable, a través de la planeación a nivel regional y territorial, logrando avances importantes en la conceptualización y metodología de su quehacer, así como en su capacidad de interlocución, para el establecimiento de un amplio espectro de relaciones de cooperación y alianza entre diversos actores de la sociedad oaxaqueña, de igual forma CAMPO, vio fortalecido su trabajo al asumir el enfoque de equidad de género y del mejoramiento ambiental, promoviendo, tanto en el ámbito rural, como urbano, nuevas actividades y estrategias con niños y jóvenes, impulsando la creación en diversas zonas del Estado, Centros Regionales de Innovación Tecnológica para el Desarrollo Sustentable.
En la actualidad CAMPO reconoce la importancia de la sustentabilidad de su proyecto estratégico basada en el fortalecimiento institucional, así como en el fortalecimiento de los distintos procesos de participación y organización desplegados por los más diversos actores de la sociedad civil oaxaqueña.